RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	IRX4	P78413	519 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CD207	Q9UJ71	328 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300		A6NNZ2	444 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZWINT	O95229	277 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ASL	P04424	464 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	HMGCL	P35914	325 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CD151	P48509	253 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	RGS19	P49795	217 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ACVR1	Q04771	509 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF460	Q14592	562 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	PEX13	Q92968	403 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	HACD3	Q9P035	362 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ECI2	O75521	394 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	KAT7	O95251	611 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ASMTL	O95671	621 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CTSL	P07711	333 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF234	Q14588	700 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CENPT	Q96BT3	561 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJC6	O75061	913 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SIN3B	O75182	1162 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	MC4R	P32245	332 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SERPINB8	P50452	374 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	IL9R	Q01113	521 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	MTSS1L	Q765P7	747 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ACOX2	Q99424	681 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	GPR22	Q99680	433 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF358	Q9NW07	568 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300		A0A096LPK6	155 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	TM9SF1	O15321	606 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	C2	P06681	752 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	HADHA	P40939	763 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	NEK3	P51956	506 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	IRF9	Q00978	393 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	USP45	Q70EL2	814 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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