RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTD1Q8N815 330 aa20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 DTD2Q96FN9 168 aa20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR26Q9H7D7 661 aa20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 IGF2RP11717 2491 aa20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SPEGQ15772 3267 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0J9YYE9 177 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM202A6NGA9 273 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 YY2O15391 372 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PRLP01236 227 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TRBC1P01850 177 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM23P36406 574 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 MARCKSL1P49006 195 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMK2BQ13554 666 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ELOCQ15369 112 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TAZQ16635 292 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CDKN3Q16667 212 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC66Q68CR7 880 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZVL8 140 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PDXPQ96GD0 296 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 LGR4Q9BXB1 951 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP41Q9BYV8 373 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 USP24Q9UPU5 2620 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 RCCD1A6NED2 376 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CST8O60676 142 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT37O76014 449 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFP01375 233 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPNS1P04632 268 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP2P08253 660 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 KELP23276 732 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CD86P42081 329 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TFDP2Q14188 446 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 KAZNQ674X7 775 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 DAAM2Q86T65 1068 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 MDM1Q8TC05 714 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 IFI44Q8TCB0 444 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 BOCQ9BWV1 1114 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF22Q9HCT0 170 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CPED1A4D0V7 1026 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPN8A6NHC0 703 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GP1BAP07359 652 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SKOR1P84550 965 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 NR0B2Q15466 257 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GUSBP11Q6P575 273 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT35Q92764 455 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 GLMNQ92990 594 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 AGAP3Q96P47 875 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF4O00268 1085 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFRSF10CO14798 259 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 OPA1O60313 960 aa20.21■□□□□ 0.83
ANKRD39-201ENST00000393537 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms