RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 FAM20CQ8IXL6 584 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TTC5Q8N0Z6 440 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf53Q8N6V4 93 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CEP112Q8N8E3 955 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATAD1Q8NBU5 361 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MCUQ8NE86 351 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMIEQ8NEW7 156 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD49Q8WVL7 239 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN17Q96FV3 270 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DPYSL5Q9BPU6 564 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM36Q9NQ86 728 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35D1Q9NTN3 355 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC11Q9NVH1 559 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PALD1Q9ULE6 856 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RWDD3Q9Y3V2 267 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT87PA6NCN2 255 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF25A6NGN4 478 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CBY3A6NI87 242 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RSPH10B2B2RC85 870 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OIP5O43482 229 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NOL3O60936 208 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CREG1O75629 220 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HEXAP06865 529 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RSPH10BP0C881 870 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 COX7A2P14406 83 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 STIP1P31948 543 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PGM1P36871 562 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WNT5AP41221 380 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 INPP1P49441 399 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NOP14P78316 857 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RPP30P78346 268 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CD83Q01151 205 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RPS6KA2Q15349 733 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MED22Q15528 200 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MTHFD1LQ6UB35 978 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1328Q86T90 577 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC83Q8IWF9 413 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PALM2Q8IXS6 379 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C14orf79Q96F83 325 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf34Q96MH7 638 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL32Q96NJ5 620 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 THAP9Q9H5L6 903 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FLRT1Q9NZU1 646 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UBE4BO95155 1302 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CGNL1Q0VF96 1302 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNF123Q5XPI4 1314 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRBC2A0A5B9 178 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LNP1A1A4G5 178 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PJA2O43164 708 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT6BP04259 564 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN1P07384 714 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM87AP0C7U9 286 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LONP1P36776 959 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC15A1P46059 708 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT6CP48668 564 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MXI1P50539 228 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLCN7P51798 805 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT81Q14533 505 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC40Q4G0X9 1142 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TTC39AQ5SRH9 613 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM111BQ6SJ93 734 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DLK2Q6UY11 383 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC65Q8IXS2 484 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf67Q8IYJ2 551 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 REPS2Q8NFH8 660 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF671Q8TAW3 534 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNFT2Q96EX2 444 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 COG3Q96JB2 828 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA12BQ96MM6 686 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM111AQ96PZ2 611 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CRAMP1Q96RY5 1269 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MPHOSPH9Q99550 1183 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC38A3Q99624 504 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRRX2Q99811 253 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TCF25Q9BQ70 676 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WDR11Q9BZH6 1224 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A32Q9H2D1 315 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms