RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 M0R3G1 203 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 AP2A1O95782 977 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MT-ND1P03886 318 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ALDH3A2P51648 485 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 HSPA2P54652 639 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 COPZ1P61923 177 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CHRNEQ04844 493 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.084e-6■■■□□ 16.5
OPN3-201ENST00000366554 CERCAMQ5T4B2 595 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CUZD1Q86UP6 607 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TTC34A8MYJ7 566 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NDUFS2O75306 463 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 UMPSP11172 480 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CDH1P12830 882 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CASP3P42574 277 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SERPINB10P48595 397 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 IMPG1Q17R60 797 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 STYK1Q6J9G0 422 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 LYSMD2Q8IV50 215 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CEP97Q8IW35 865 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 DNAAF3Q8N9W5 541 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 DNERQ8NFT8 737 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CHAC2Q8WUX2 184 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NECTIN3Q9NQS3 549 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NR5A2O00482 541 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 AREL1O15033 823 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ALPLP05186 524 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CAPN3P20807 821 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ACAP2Q15057 778 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PID1Q7Z2X4 250 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 OR13J1Q8NGT2 312 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 BDH2Q9BUT1 245 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NTN4Q9HB63 628 aa21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 RGS20O76081 388 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 MT-CO1P00395 513 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 AHSGP02765 367 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 RAB10P61026 200 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 STX1BP61266 288 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 SPATS1Q496A3 300 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 CCDC185Q8N715 623 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 MUC13Q9H3R2 512 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 ATP6AP2O75787 350 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 UPK1BO75841 260 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 GSNP06396 782 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 PODNQ7Z5L7 613 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 LRRC58Q96CX6 371 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 UPK1AO00322 258 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 THRBP10828 461 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 DAG1Q14118 895 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 DACT2Q5SW24 774 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 FAM219BQ5XKK7 198 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 SIGIRRQ6IA17 410 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 C11orf74Q86VG3 221 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 ANKK1Q8NFD2 765 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 CHID1Q9BWS9 393 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 TRIM8Q9BZR9 551 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 OR2B2Q9GZK3 357 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.76■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.75■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
OPN3-201ENST00000366554 VWA5AO00534 786 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms