RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 PLLPQ9Y342 182 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 RFXAPO00287 272 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 MAP3K7O43318 606 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 AHSGP02765 367 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 PIRTP0C851 137 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 T-ENOLP0DO92 83 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 WEE1P30291 646 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CRHR1P34998 444 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CSRP3P50461 194 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SLC34A1Q06495 639 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 PTPRCAPQ14761 206 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 GSTA3Q16772 222 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 FUT11Q495W5 492 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 ARL5AQ9Y689 179 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.14□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 PFDN1O60925 122 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CBX6O95503 412 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SLC1A2P43004 574 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CTBP1Q13363 440 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SLC12A1Q13621 1099 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 RAB30Q15771 203 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 RETSATQ6NUM9 610 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 NCSTNQ92542 709 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SPOCK2Q92563 424 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 HIC2Q96JB3 615 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 VPS39Q96JC1 886 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SNX15Q9NRS6 342 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CCL22O00626 93 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 FZD6O60353 706 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 GMPRP36959 345 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 GRM3Q14832 879 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 PPM1JQ5JR12 505 aa11.13□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.13□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 STMN2Q93045 179 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 VOPP1Q96AW1 172 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 GPR22Q99680 433 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CENPKQ9BS16 269 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 BBS2Q9BXC9 721 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 RHOJQ9H4E5 214 aa11.13□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 MARK1Q9P0L2 795 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 EMCNQ9ULC0 261 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.13□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.12□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 SERPINB8P50452 374 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 PDE1BQ01064 536 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 NEPROQ6NW34 567 aa11.12□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 HDAC10Q969S8 669 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 WDR91A4D1P6 747 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 SLC7A4O43246 635 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 TIMM44O43615 452 aa11.12□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 ATP6V1G1O75348 118 aa11.12□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.12□□□□□ -0.63
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ABCD4-201ENST00000356924 BMP1P13497 986 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 TYRP14679 529 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 PSMA3P25788 255 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 CSNK1DP48730 415 aa11.12□□□□□ -0.63
ABCD4-201ENST00000356924 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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