RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 TPGS2Q68CL5 300 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO30Q8TB52 745 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB3Q9Y575 518 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PEAK1Q9H792 1746 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPM1 405 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ARVCFO00192 962 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 UMPSP11172 480 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNB2P17787 502 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 JAK1P23458 1154 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD5Q6N075 450 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf64Q86WR6 236 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR156Q8NFN8 814 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TCF25Q9BQ70 676 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R2N6 131 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10H2O60403 315 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 STBD1O95210 358 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EPORP19235 508 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 HNF4AP41235 474 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CDH13P55290 713 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 DSC2Q02487 901 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 OR7D4Q8NG98 312 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6A2O95222 327 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHX1P07099 455 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MYL12AP19105 171 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHA3P29320 983 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CRHR1P34998 444 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 TALDO1P37837 337 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 MARK4Q96L34 752 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM30Q9UKF2 790 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP4-201ENST00000344528 GSAPA4D1B5 854 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BM21 787 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNDBP1O95273 360 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 FYNP06241 537 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CCR3P51677 355 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 BNIP2Q12982 314 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SCIMPQ6UWF3 145 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF567Q8N184 647 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL3Q9UH77 587 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SCNN1AP37088 669 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A3Q00325 362 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 DDHD1Q8NEL9 900 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TEKT5Q96M29 485 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CDH19Q9H159 772 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM38O00635 465 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 INSIG1O15503 277 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6AP2O75787 350 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 VNN1O95497 513 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CHSY3Q70JA7 882 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4X1Q8N118 509 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RORBQ92753 470 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SIX2Q9NPC8 291 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 FSBPO95073 299 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMG1O95456 288 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC159P0C7I6 412 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM124AQ86V42 546 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 GATAD2AQ86YP4 633 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms