RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 ATE1O95260 518 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TBX4P57082 545 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 GIPC2Q8TF65 315 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC39Q96DD0 335 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 P2RY11Q96G91 374 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 MYRFLQ96LU7 910 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 ETV3P41162 512 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 NDST2P52849 883 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 CDONQ4KMG0 1287 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 AHI1Q8N157 1196 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 FEM1CQ96JP0 617 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TCF12Q99081 682 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 LGMNQ99538 433 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 KCNK13Q9HB14 408 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 FANCEQ9HB96 536 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 CLOCKO15516 846 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 SPAG6O75602 509 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 URODP06132 367 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 CSH1P0DML2 217 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 CSH2P0DML3 217 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 PPP3CCP48454 512 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 RAB15P59190 212 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 CDKL1Q00532 357 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TRABD2AQ86V40 505 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TDRPQ86YL5 185 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 TSGA13Q96PP4 275 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 BTBD9Q96Q07 612 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXA3-201ENST00000317201 CFAP99D6REC4 459 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 SOAT2O75908 522 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 MAP3K6O95382 1288 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 KRT4P19013 534 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CXCR2P25025 360 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ISOC1Q96CN7 298 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 YME1L1Q96TA2 773 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 Q9H521 79 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 THAP1Q9NVV9 213 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 RNF103O00237 685 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 MLNP12872 115 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 MAGEA3P43357 314 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 NRLP54845 237 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 FGD3Q5JSP0 725 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 AFMIDQ63HM1 303 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 NPWQ8N729 165 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 NUF2Q9BZD4 464 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PLK2Q9NYY3 685 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CLUHO75153 1309 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TAF4O00268 1085 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 METTL18O95568 372 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CCNYQ8ND76 341 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GPR152Q8TDT2 470 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 DPF3Q92784 378 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRSQ13332 1948 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 E9PAM4 449 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GJB5O95377 273 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 FGBP02675 491 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ACRP10323 421 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CCNCP24863 283 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 EFEMP1Q12805 493 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms