RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 HERVK_113Q902F9 699 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 RAD9AQ99638 391 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC28BQ9BUN5 200 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 LZTS1Q9Y250 596 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 IRAK3Q9Y616 596 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 HELZP42694 1942 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PFDN6O15212 129 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CA8P35219 290 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PGM1P36871 562 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 RAP1GDS1P52306 607 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PTPRCAPQ14761 206 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 HTR3DQ70Z44 454 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 GAREM2Q75VX8 874 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 RNF135Q8IUD6 432 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 FAR2Q96K12 515 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 GCNAQ96QF7 691 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 VPS51Q9UID3 782 aa18.49■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 LCHNA4D1U4 455 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 A8MT66 165 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PEX11AO75192 247 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ADH1AP07327 375 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 TFEBP19484 476 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CDC25CP30307 473 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CSKP41240 450 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 RHOAP61586 193 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 AP1S1P61966 158 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 MXRA7P84157 204 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ZXDBP98169 803 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 TRAF2Q12933 501 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SEMA3AQ14563 771 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ICE2Q659A1 982 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 MDGA1Q8NFP4 955 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 MAPK15Q8TD08 544 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ALG14Q96F25 216 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.48■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SLC22A2O15244 555 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 GRID2O43424 1007 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 COPAP53621 1224 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ERVFC1P60507 584 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CYP4F8P98187 520 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 MPP7Q5T2T1 576 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 RETSATQ6NUM9 610 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 LINGO4Q6UY18 593 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 MFN1Q8IWA4 741 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SGF29Q96ES7 293 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PLA2G4CQ9UP65 541 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CDYLQ9Y232 598 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 TRPC5OSA6NMA1 111 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SLC4A1P02730 911 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CKMP06732 381 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 C8AP07357 584 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PDHA1P08559 390 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 BMPR1AP36894 532 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 NFKB2Q00653 900 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 MPPE1Q53F39 396 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 GPR158Q5T848 1215 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 WLSQ5T9L3 541 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 AGR3Q8TD06 166 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ACDQ96AP0 544 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 TRMOQ9BU70 441 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.47■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 H7C0S8 307 aa18.46■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 SMIM24O75264 130 aa18.46■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 TM7SF2O76062 418 aa18.46■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HCLS1-201ENST00000314583 NAA25Q14CX7 972 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms