RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299022.9

LIPC-201, Transcript of lipase C, hepatic type, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPC, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPC-201ENST00000299022 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.9□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 A0A087X1B8 175 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ACOT8O14734 319 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 UBDO15205 165 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SEPT4O43236 478 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 COL6A2P12110 1019 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ATP6V1B1P15313 513 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CES1P23141 567 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ME2P23368 584 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PSME3P61289 254 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ZNF33AQ06730 810 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 LRGUKQ96M69 825 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 TMEM165Q9HC07 324 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SCML2Q9UQR0 700 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PTPRDP23468 1912 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 AP3B1O00203 1094 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RAMP2O60895 175 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CRTAMO95727 393 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CKBP12277 381 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 DUSP4Q13115 394 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 REP15Q6BDI9 236 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 NUDT8Q8WV74 236 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SPON2Q9BUD6 331 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.89□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 MROH6A6NGR9 719 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 NPHS1O60500 1241 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 GPC4O75487 556 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 VNN2O95498 520 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RHOQP17081 205 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 APLP1P51693 650 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 GRB7Q14451 532 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 UNC50Q53HI1 259 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RETREG3Q86VR2 466 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SCML4Q8N228 414 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 BHMTQ93088 406 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SERPINI1Q99574 410 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 TIMM22Q9Y584 194 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CCDC160A6NGH7 325 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 LINC00032P0C843 101 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 UGT1A6P19224 532 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 FMO4P31512 558 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SLC6A4P31645 630 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 SGSHP51688 502 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 INHBCP55103 352 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ADGRE1Q14246 886 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 RGMBQ6NW40 437 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 KLC3Q6P597 504 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.88□□□□□ -0.83
LIPC-201ENST00000299022 LGI2Q8N0V4 545 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms