RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MYO19Q96H55 970 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FKBPLQ9UIM3 349 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PGLSO95336 258 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ALPIP09923 528 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC166P0CW27 439 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PLK1P53350 603 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FUT11Q495W5 492 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FAM45BPQ6NSW5 357 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FAM45AQ8TCE6 357 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 SGF29Q96ES7 293 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 EBF4Q9BQW3 602 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TLE6Q9H808 572 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 NOTCH4Q99466 2003 aa22.77■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 DLX3O60479 287 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CBX6O95503 412 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 T-ENOLP0DO92 83 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 LIPMQ5VYY2 423 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TTC7BQ86TV6 843 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 BBS2Q9BXC9 721 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 HAO1Q9UJM8 370 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CEBPBP17676 345 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 GRIA4P48058 902 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF77Q15935 545 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 LEMD2Q8NC56 503 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 IRF7Q92985 503 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 WWP1Q9H0M0 922 aa22.76■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA4LO95757 839 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SRCP12931 536 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MC4RP32245 332 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 BCL2L1Q07817 233 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MAVSQ7Z434 540 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL29Q96CT2 875 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 EID2BQ96D98 161 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CERS4Q9HA82 394 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF711Q9Y462 761 aa22.75■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM114B3SHH9 223 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FDXRP22570 491 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CCR10P46092 362 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 NAGLUP54802 743 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ2P63252 427 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 GPM6BQ13491 265 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ASRGL1Q7L266 308 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FAM136AQ96C01 138 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM237Q96Q45 408 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNGP07510 517 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SLC20A2Q08357 652 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PEX6Q13608 980 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 HACD3Q9P035 362 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.74■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FCHO1O14526 889 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF6O95976 241 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TYRP14679 529 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CSNK1DP48730 415 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 USP4Q13107 963 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms