RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHL35Q6PF15 583 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PAEPP09466 180 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CNTFP26441 200 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 LBX1P52954 281 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CDH13P55290 713 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZPBP2Q6X784 338 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PPTC7Q8NI37 304 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 25.7
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.88□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ANXA6P08133 673 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 LMX1AQ8TE12 382 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GDPD5Q8WTR4 605 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PPCDCQ96CD2 204 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BNH8 94 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SMPD1P17405 629 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GRIA4P48058 902 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CAP1Q01518 475 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KXD1Q9BQD3 176 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM227AF5H4B4 570 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CHAF1BQ13112 559 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MAMLD1Q13495 774 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 C17orf64Q86WR6 236 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 OR7D4Q8NG98 312 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 HBEGFQ99075 208 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CENPXA8MT69 81 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MAGEB3O15480 346 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 RTP1P59025 263 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP2R2BQ00005 443 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM187BQ17R55 369 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ABI3Q9P2A4 366 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FSHRP23945 695 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPK8P45983 427 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PDX1P52945 283 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 UBXN11Q5T124 520 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GGA2Q9UJY4 613 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 VAV3Q9UKW4 847 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ULK1O75385 1050 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 RCVRNP35243 200 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FAR1Q8WVX9 515 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MPP4Q96JB8 637 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 YIPF4Q9BSR8 244 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PRDM12Q9H4Q4 367 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CMTM6Q9NX76 183 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 USP31Q70CQ4 1352 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 E9PCH4 1651 aa11.86□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PROCP04070 461 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms