RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ticam2Q8BJQ4 232 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sept10Q8C650 452 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zswim3Q8CFL8 695 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PvrQ8K094 408 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtg1Q8R2R6 326 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps39Q8R5L3 886 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Guca1bQ8VBV8 201 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cybrd1Q925G2 290 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nuf2Q99P69 463 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacng3Q9JJV5 315 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Extl1Q9JKV7 669 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smok1Q9QYZ4 484 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syt5Q9R0N5 386 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nme4Q9WV84 186 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gipc1Q9Z0G0 333 aa6.62□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akain1G3UWD5 69 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6614M0QWR8 670 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mknk1O08605 427 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fpr-rs3O88537 343 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ClppO88696 272 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GhrP16882 650 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tap2P36371 702 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Faf1P54731 649 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AxlQ00993 888 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Afap1l2Q5DTU0 825 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dyrk2Q5U4C9 599 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adora2aQ60613 410 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ei24Q61070 340 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MafkQ61827 156 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Six3Q62233 333 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sez6lQ6P1D5 963 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Camk1dQ8BW96 385 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plcl2Q8K394 1128 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Timd2Q8R183 305 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Batf2Q8R1H8 277 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gramd1aQ8VEF1 722 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc5a2Q923I7 670 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam33Q923W9 797 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Doc2gQ9ESN1 387 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Timp4Q9JHB3 224 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpc4apQ9JLV2 797 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdh17Q9R100 827 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam23Q9R1V7 829 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8113E0CXS8 587 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn5O08688 640 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stam2O88811 523 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01669 111 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nedd8P29595 81 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GemP55041 295 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hcrtr1P58307 416 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itga11P61622 1188 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tll1Q62381 1013 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map2k2Q63932 401 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Casc4Q6P2L7 435 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec7aQ6QLQ4 244 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 InavaQ7TN12 663 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr301Q7TS04 311 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btnl1Q7TST0 509 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcsk9Q80W65 694 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cnpy4Q8BQ47 245 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8CCC3 530 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc66Q8K0B3 872 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ipo13Q8K0C1 963 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lurap1lQ8K2P1 221 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wnt9aQ8R5M2 365 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stard13Q923Q2 1113 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Retreg3Q9CQV4 466 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zcchc12Q9CZA5 402 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slco1c1Q9ERB5 715 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nt5cQ9JM14 200 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm28363A0A087WQW2 129 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zmynd12A2BGJ5 363 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r27D3YUK6 857 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifit3bE9PV48 403 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21738J3QP72 227 aa6.61□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r46L7N282 809 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.1 ms