RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621829.4

CLTC-215, Transcript of clathrin heavy chain, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CLTC, Length 8,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLTC-215	ENST00000621829	GIT2	Q14161	759 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NKD1	Q969G9	470 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	WRB	O00258	174 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SUV39H1	O43463	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	STARD8	Q92502	1023 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	KCNA5	P22460	613 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CHAD	O15335	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CLU	P10909	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	C2orf74	A8MZ97	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CTSH	P09668	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	VDR	P11473	427 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MSR1	P21757	451 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SLC6A2	P23975	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FNTB	P49356	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	GNG2	P59768	71 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TGM3	Q08188	693 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR2L3	Q8NG85	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	STOML3	Q8TAV4	291 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MSH4	O15457	936 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CBX4	O00257	560 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FBP2	O00757	339 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RFXANK	O14593	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PLD2	O14939	933 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CDH15	P55291	814 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OXR1	Q8N573	874 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MICAL2	O94851	1124 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NR2F1	P10589	423 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	GABRB2	P47870	512 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ILVBL	A1L0T0	632 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	IDO1	P14902	403 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MPST	P25325	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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