RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0U1RQS6 177 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ILVBLA1L0T0 632 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3LB9A6J9 549 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V1G2O95670 118 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 GSTA1P08263 222 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3HP0C7X1 549 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CNR2P34972 360 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 DRD3P35462 400 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 DYNLT1P63172 113 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 WLSQ5T9L3 541 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAF4L2Q8NA75 395 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 BIRC7Q96CA5 298 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SNF8Q96H20 258 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 NOD2Q9HC29 1040 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TTLL3Q9Y4R7 772 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA4FO95754 770 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC4O95801 387 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ASLP04424 464 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 MYBL1P10243 752 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 IVDP26440 423 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 RGRP47804 291 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SCAPQ12770 1279 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT81Q14533 505 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPRRQ15256 657 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TCEA2Q15560 299 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS37AQ8NEZ2 397 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SLCO2A1Q92959 643 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM117AQ9C073 453 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 MCM8Q9UJA3 840 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 C4orf47A7E2U8 309 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF217O75362 1048 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 RHOBTB1O94844 696 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGNO95427 931 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 GAS8O95995 478 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT2B4P06133 528 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 DESP17661 470 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ADCY8P40145 1251 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 MAXP61244 160 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 MPP2Q14168 576 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINB12Q96P63 405 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CSPG4P5Q96PW8 444 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP41Q9BYV8 373 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDH18Q9HCL0 1135 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TMCC1O94876 653 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 BRAFP15056 766 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PLK1P53350 603 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNJ2P63252 427 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 IL9RQ01113 521 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP4X1Q8N118 509 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ARRDC3Q96B67 414 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 IL21RQ9HBE5 538 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 HS3ST2Q9Y278 367 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PCNX2A6NKB5 2137 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 F5H423 210 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC31A1O15431 190 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SULT2A1Q06520 285 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PTK6Q13882 451 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 RETSATQ6NUM9 610 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PRUNE1Q86TP1 453 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD6Q8NC69 237 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 OR8D1Q8WZ84 308 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 C9orf72Q96LT7 481 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 NINJ2Q9NZG7 142 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ANAPC5Q9UJX4 755 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SHROOM3Q8TF72 1996 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRD1A4D1F6 860 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 H0Y8X5 98 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 MUSKO15146 869 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP9BO43861 1147 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms