RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5M	Q9NPB1	228 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		21.84	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF487	B1APH4	448 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	YY2	O15391	372 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	FZD6	O60353	706 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CP	P00450	1065 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR1B	P28222	390 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	BLK	P51451	505 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PELI3	Q8N2H9	469 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PAF1	Q8N7H5	531 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TC2N	Q8N9U0	490 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SCRN2	Q96FV2	425 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA3C	Q99985	751 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DTL	Q9NZJ0	730 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	INTU	Q9ULD6	942 aa		21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	21.83	■■□□□ 1.09
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		21.83	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OPA1	O60313	960 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LHCGR	P22888	699 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	VIPR1	P32241	457 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1024L	P59773	190 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	VSIG1	Q86XK7	387 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR92	Q96MX6	357 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	AMACR	Q9UHK6	382 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		21.82	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MT-CO3	P00414	261 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PDHA1	P08559	390 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RTP5	Q14D33	572 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOX1	Q15067	660 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRR	Q15256	657 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CDKN3	Q16667	212 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HID1	Q8IV36	788 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PLD5	Q8N7P1	536 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC11	Q96DB2	347 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PDXP	Q96GD0	296 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		21.81	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	21.81	■■□□□ 1.08	4e-6	■□□□□ 10.3
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRD1	A4D1F6	860 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM202	A6NGA9	273 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RASGRP1	O95267	797 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA6	P08133	673 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNB1	P14635	433 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MX2	P20592	715 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CES1	P23141	567 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC38	Q5VT99	294 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PNCK	Q6P2M8	343 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	GUSBP11	Q6P575	273 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ATL2	Q8NHH9	583 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI44	Q8TCB0	444 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LGR4	Q9BXB1	951 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM5	Q9C035	493 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF22	Q9HCT0	170 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	KL	Q9UEF7	1012 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RAX	Q9Y2V3	346 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD11	O00231	422 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DSC2	Q02487	901 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOC	Q15369	112 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	NR0B2	Q15466	257 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	NXPE2	Q96DL1	559 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DTD2	Q96FN9	168 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		21.8	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF10C	O14798	259 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LCA5L	O95447	670 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DQB2	P05538	268 aa		21.79	■■□□□ 1.08

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