RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556579.5

WARS-231, Transcript of tryptophanyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene WARS, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WARS-231	ENST00000556579	CD48	P09326	243 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TPM1	P09493	284 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	IL4R	P24394	825 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	VIPR1	P32241	457 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ITK	Q08881	620 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	DPYSL3	Q14195	570 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TCEA2	Q15560	299 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PERM1	Q5SV97	790 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	NUS1	Q96E22	293 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.26	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	LRP4	O75096	1905 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	MFSD11	O43934	449 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TCEA3	O75764	348 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	MPO	P05164	745 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	KRT10	P13645	584 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ARSE	P51690	589 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	GABRE	P78334	506 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TRAF2	Q12933	501 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PDK2	Q15119	407 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	CNGA3	Q16281	694 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	USP45	Q70EL2	814 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29	1e-8	■■□□□ 11.5
WARS-231	ENST00000556579	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	APC2	O95996	2303 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ACACA	Q13085	2346 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.25	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PSMD11	O00231	422 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	AKR1B10	O60218	316 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PGLS	O95336	258 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	GM2A	P17900	193 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TRIM23	P36406	574 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	LSS	P48449	732 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	GALNT2	Q10471	571 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SPIDR	Q14159	915 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	KY	Q8NBH2	561 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.24	□□□□□ -0.29
WARS-231	ENST00000556579	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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