RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS38	A1L453	326 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		H0Y626	953 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		M0QYT0	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM24	O15164	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR39	O43194	453 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TBL1X	O60907	577 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ATG13	O75143	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	APOE	P02649	317 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KLKB1	P03952	638 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TYR	P14679	529 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRNB2	P17787	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCB4	P21439	1286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DRD1	P21728	446 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CHKA	P35790	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CXCL12	P48061	93 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC11A2	P49281	568 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SULT1E1	P49888	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TUB	P50607	506 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CDR2	Q01850	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MTAP	Q13126	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PDCL	Q13371	301 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CDO1	Q16878	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RELT	Q969Z4	430 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PRRX2	Q99811	253 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ACSL4	O60488	711 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OPHN1	O60890	802 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HSF2BP	O75031	334 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TULP3	O75386	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KAT7	O95251	611 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OLFM2	O95897	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PLAT	P00750	562 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRNB1	P11230	501 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT3	P12035	628 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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