RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SATL1	Q86VE3	508 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	JAML	Q86YT9	394 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	KDM1B	Q8NB78	822 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB124	Q8NES8	71 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GPR174	Q9BXC1	333 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	LHX5	Q9H2C1	402 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ACP6	Q9NPH0	428 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM131	Q92545	1883 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GTW7	788 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	THAP12	O43422	761 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	OPHN1	O60890	802 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CD59	P13987	128 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BRAF	P15056	766 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GNS	P15586	552 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NAT1	P18440	290 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZBTB16	Q05516	673 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HES6	Q96HZ4	224 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SYNC	Q9H7C4	482 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PLXNA2	O75051	1894 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MEI4	A8MW99	385 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf142	B7Z368	130 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ACADM	P11310	421 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TACR2	P21452	398 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MAOB	P27338	520 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CSK	P41240	450 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLC14A1	Q13336	389 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DCAF6	Q58WW2	860 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ADAM32	Q8TC27	787 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf82	Q8WW14	230 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SERPINB12	Q96P63	405 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CPXM1	Q96SM3	734 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLC32A1	Q9H598	525 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF711	Q9Y462	761 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GSC2	O15499	205 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	APOE	P02649	317 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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