RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 OR2T3Q8NH03 318 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LMX1AQ8TE12 382 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ERP44Q9BS26 406 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RMI1Q9H9A7 625 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GLOD4Q9HC38 313 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 C5P01031 1676 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CHADO15335 359 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GSRP00390 522 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 C8GP07360 202 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CCKBRP32239 447 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MUM1Q2TAK8 710 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GALNT7Q86SF2 657 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MYOCQ99972 504 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ADA2Q9NZK5 511 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 AURKCQ9UQB9 309 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ACOT7O00154 380 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LEFTY2O00292 366 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ATG7O95352 703 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KRT8P05787 483 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 NR6A1Q15406 480 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 THAP2Q9H0W7 228 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 COL18A1P39060 1754 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CASZ1Q86V15 1759 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 INSIG1O15503 277 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LRCH4O75427 683 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 NR1D1P20393 614 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KCNA3P22001 575 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 HK2P52789 917 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LSMEM2Q8N112 164 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RIN3Q8TB24 985 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TOP1MTQ969P6 601 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PCED1BQ96HM7 432 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PALMDQ9NP74 551 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SPAG7O75391 227 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 STBD1O95210 358 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 OTCP00480 354 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SLCO1A2P46721 670 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MAPK10P53779 464 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RRADP55042 308 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 POU6F1Q14863 301 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TAF13Q15543 124 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAR1Q8WVX9 515 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CEP19Q96LK0 163 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DLX3O60479 287 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CFHP08603 1231 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KDELR1P24390 212 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CYP51A1Q16850 503 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RNF157Q96PX1 679 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MIPEPQ99797 713 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 NPHS2Q9NP85 383 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CYP1A2P05177 515 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FGFR3P22607 806 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SLC8A1P32418 973 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms