RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 S1PR4O95977 384 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SRCP12931 536 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 HOXA9P31269 272 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 STX3Q13277 289 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 STYXQ8WUJ0 223 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FGF13Q92913 245 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RANBP9Q96S59 729 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ABCG8Q9H221 673 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 DPP7Q9UHL4 492 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 F5P12259 2224 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FGF19O95750 216 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GSRP00390 522 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PROCP04070 461 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 UGT2B4P06133 528 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 43.3
CS-215ENST00000549143 FMO4P31512 558 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PLK1P53350 603 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ECT2LQ008S8 904 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MESP2Q0VG99 397 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SLC12A1Q13621 1099 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PCLAFQ15004 111 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZNF77Q15935 545 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GEN1Q17RS7 908 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ATG16L1Q676U5 607 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 OR2AP1Q8NGE2 309 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MYO19Q96H55 970 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MSRAQ9UJ68 235 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 VWA7Q9Y334 891 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ALPK3Q96L96 1907 aa8.43□□□□□ -1.06
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CS-215ENST00000549143 OR1I1O60431 355 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CLDN7O95471 211 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 IGSF6O95976 241 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MPOP05164 745 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CCDC166P0CW27 439 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CES1P23141 567 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 MC4RP32245 332 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CDKN2DP55273 166 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 DHCR24Q15392 516 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TMEM215Q68D42 235 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 FITM2Q8N6M3 262 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 EXT2Q93063 718 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 EID2BQ96D98 161 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 XPR1Q9UBH6 696 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PKP3Q9Y446 797 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 LINC01565O15544 149 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 NDUFS3O75489 264 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 PGLSO95336 258 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 RALBP11234 206 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 ARSAP15289 507 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-215ENST00000549143 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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