RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	RANBP9	Q96S59	729 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PREB	Q9HCU5	417 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658		H0Y858	1186 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PSMD11	O00231	422 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	AXIN1	O15169	862 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	AP1G1	O43747	822 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFS2	O75306	463 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	POLB	P06746	335 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PGAM1	P18669	254 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	HADHA	P40939	763 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ELK3	P41970	407 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEA3	P43357	314 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TPMT	P51580	245 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CRADD	P78560	199 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ITM2B	Q9Y287	266 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658		E7ESA3	106 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	BANF1	O75531	89 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN7	O95471	211 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	TTC4	O95801	387 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	UQCRH	P07919	91 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ECHS1	P30084	290 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	CD6	P30203	668 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PHB	P35232	272 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	ADPRH	P54922	357 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDB1-223	ENST00000543658	PRAME	P78395	509 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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