RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 SEC14L1Q92503 715 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 PEX13Q92968 403 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 SERPINB12Q96P63 405 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 RANBP9Q96S59 729 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 FMO2Q99518 471 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 APOL2Q9BQE5 337 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-213ENST00000493945 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 AREL1O15033 823 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TM7SF2O76062 418 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TMEM63AO94886 807 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PRLP01236 227 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CTPS1P17812 591 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ADRA1DP25100 572 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 DPP6P42658 865 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PLTPP55058 493 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ANGPT1Q15389 498 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ELF2Q15723 593 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PCID2Q5JVF3 399 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TRIM69Q86WT6 500 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 IFT81Q8WYA0 676 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MEI4A8MW99 385 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TTC4O95801 387 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SLC4A1P02730 911 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 IVDP26440 423 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 HNF1BP35680 557 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 HMGCLP35914 325 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ABL2P42684 1182 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CHRNA4P43681 627 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CCR5P51681 352 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 POU6F1Q14863 301 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ACOX1Q15067 660 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ZNF284Q2VY69 593 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MAP9Q49MG5 647 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 LRRC66Q68CR7 880 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 HORMAD1Q86X24 394 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 STYXQ8WUJ0 223 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ART4Q93070 314 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PRR23AA6NEV1 266 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 WNT9AO14904 365 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PFDN6O15212 129 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RHOBTB1O94844 696 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ALPIP09923 528 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TNFRSF8P28908 595 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 FNTBP49356 437 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 LIG3P49916 1009 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 PTPN5P54829 565 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SLMAPQ14BN4 828 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 BBS9Q3SYG4 887 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 CEP68Q76N32 757 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 GAB3Q8WWW8 586 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 ASB12Q8WXK4 309 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 TTC1Q99614 292 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 GDF3Q9NR23 364 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-213ENST00000493945 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms