RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 SCMH1Q96GD3 660 aa6.06□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 PROCRQ9UNN8 238 aa6.06□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.06□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.06□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 TNFSF14O43557 240 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 EDN2P20800 178 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 RRM1P23921 792 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SSTR2P30874 369 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 CDAP32320 146 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 EFNA5P52803 228 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 DDR1Q08345 913 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 COASYQ13057 564 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 TDRPQ86YL5 185 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 ZBTB2Q8N680 514 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 ASAH2Q9NR71 780 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 HAO1Q9UJM8 370 aa6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 A0A1B0GUV1 79 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SMTNL1A8MU46 457 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 EFNB3Q15768 340 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 USP41Q3LFD5 358 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 LCTLQ6UWM7 567 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 WDR63Q8IWG1 891 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 NEK9Q8TD19 979 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 PPM1MQ96MI6 270 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 GAREM1Q9H706 876 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.04□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 NDUFS7O75251 213 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 RFPL2O75678 378 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 AGR2O95994 175 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 MAOAP21397 527 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 ELF1P32519 619 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 CASP6P55212 293 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 TNFAIP1Q13829 316 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 CCNG2Q16589 344 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 MMEL1Q495T6 779 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 RFFLQ8WZ73 363 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 NDST4Q9H3R1 872 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 GPR108Q9NPR9 543 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.03□□□□□ -1.44
USP34-216ENST00000487547 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 SEC14L2O76054 403 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 CLDN14O95500 239 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 PMS2P2O95744 297 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 UBL4AP11441 157 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 SORDQ00796 357 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 POU5F1BQ06416 359 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 OLIG2Q13516 323 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 NAE1Q13564 534 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 CDC73Q6P1J9 531 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.02□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 TANKQ92844 425 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms