RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482507.5

ATG4B-220, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-220ENST00000482507 ITGB1P05556 798 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PSMD8P48556 350 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SLC12A2P55011 1212 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 MAXP61244 160 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 AHI1Q8N157 1196 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 A0A0U1RQF3 1178 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 E9PAM4 449 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 B3GAT3O94766 335 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 C8BP07358 591 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PAMP19021 973 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ARSDP51689 593 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SLC5A3P53794 718 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TTC3P53804 2025 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CDKN2DP55273 166 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 NRF1Q16656 503 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 MYLK3Q32MK0 819 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SCML4Q8N228 414 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 FAM110BQ8TC76 370 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 LPGAT1Q92604 370 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 Q9H521 79 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 OSER1Q9NX31 292 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SARDHQ9UL12 918 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 OR51F1A6NGY5 319 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 UBDO15205 165 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ATP6AP2O75787 350 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ODC1P11926 461 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 FGFR3P22607 806 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CCR1P32246 355 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 BIRC2Q13490 618 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 LAYNQ6UX15 382 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PIM3Q86V86 326 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 LZTR1Q8N653 840 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 C3orf30Q96M34 536 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 J3KR12 359 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TNFRSF10BO14763 440 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 APOFQ13790 326 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SQLEQ14534 574 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 SLC14A2Q15849 920 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TOX2Q96NM4 488 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ETAA1Q9NY74 926 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CD300AQ9UGN4 299 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 AP4S1Q9Y587 144 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 KCTD3Q9Y597 815 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TET1Q8NFU7 2136 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PITPNM1O00562 1244 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 MMP2P08253 660 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CD86P42081 329 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 CREB5Q02930 508 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 USP41Q3LFD5 358 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-220ENST00000482507 MPP4Q96JB8 637 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms