RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481655.2

CTCFL-210, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-210ENST00000481655 KIFC1Q9BW19 673 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 FZD4Q9ULV1 537 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 SOX13Q9UN79 622 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 PKP3Q9Y446 797 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.97□□□□□ -0.01
CTCFL-210ENST00000481655 H0Y858 1186 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 TSPAN6O43657 245 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 AP1G1O43747 822 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 SLC4A1P02730 911 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 FAM153BP0C7A2 387 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 GABRG2P18507 467 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PHBP35232 272 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 MMP12P39900 470 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PMS2P54278 862 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 MTAPQ13126 283 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 FAM153CQ494X1 144 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ANO7Q6IWH7 933 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 DPPA4Q7L190 304 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 AADATQ8N5Z0 425 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CFAP36Q96G28 342 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.96□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PSMD11O00231 422 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ZNF217O75362 1048 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 BANF1O75531 89 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 USP1O94782 785 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PRKCGP05129 697 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 GSTA2P09210 222 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ELFN1P0C7U0 828 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 DRD3P35462 400 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 HMGCLP35914 325 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 HADHAP40939 763 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 METAP1P53582 386 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 AGBL4Q5VU57 503 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 LRRC66Q68CR7 880 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 MPP5Q8N3R9 675 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 STYXQ8WUJ0 223 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 C9orf72Q96LT7 481 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 HHIPQ96QV1 700 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 RAD18Q9NS91 495 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ARL5AQ9Y689 179 aa14.95□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 MROH6A6NGR9 719 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 AREL1O15033 823 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 LDB2O43679 373 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 OXTRP30559 389 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 TMEM135Q86UB9 458 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 SGK2Q9HBY8 427 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.94□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CKAP5Q14008 2032 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 A8MX80 341 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PLK4O00444 970 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PCDH8O95206 1070 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CLDN7O95471 211 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 STX2P32856 288 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 PRAMEP78395 509 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 CRYMQ14894 314 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 KYNUQ16719 465 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.93□□□□□ -0.02
CTCFL-210ENST00000481655 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms