RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PIGN	O95427	931 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ECEL1	O95672	775 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	THRA	P10827	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ADRA1B	P35368	520 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ABHD18	Q0P651	414 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	BIRC2	Q13490	618 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GRM3	Q14832	879 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TRNP1	Q6NT89	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FAM129C	Q86XR2	697 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NRROS	Q86YC3	692 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	BMPER	Q8N8U9	685 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NELFB	Q8WX92	580 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	STARD8	Q92502	1023 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	RTP4	Q96DX8	246 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	LGR4	Q9BXB1	951 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	LHX3	Q9UBR4	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	POLQ	O75417	2590 aa		10.62	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PRSS38	A1L453	326 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FAM72C	H0Y354	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	VPS4B	O75351	444 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	LRIG2	O94898	1065 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PRKCG	P05129	697 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TCN2	P20062	427 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NR1D1	P20393	614 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	BMP6	P22004	513 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MPST	P25325	297 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CLCN1	P35523	988 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ATP11A	P98196	1134 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	APBA1	Q02410	837 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CYTH1	Q15438	398 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CFAP58	Q5T655	872 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ARC	Q7LC44	396 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	FAM72B	Q86X60	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PATE1	Q8WXA2	126 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	EXOC2	Q96KP1	924 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	KLC2	Q9H0B6	622 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	WDR26	Q9H7D7	661 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PDP2	Q9P2J9	529 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	VPS4A	Q9UN37	437 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	NEU3	Q9UQ49	428 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	KCTD3	Q9Y597	815 aa		10.61	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279		K7EM74	188 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PPM1D	O15297	605 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GNLY	P22749	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	CSF2RB	P32927	897 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MAN1A1	P33908	653 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	BPIFB4	P59827	614 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	GPLD1	P80108	840 aa		10.6	□□□□□ -0.71
APTX-222	ENST00000478279	MC2R	Q01718	297 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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