RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 ICAM3P32942 547 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 THPOP40225 353 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TSPAN7P41732 249 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 EFNB1P98172 346 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ERV3-1Q14264 604 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 NFIL3Q16649 462 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 NAA35Q5VZE5 725 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TXNDC8Q6A555 127 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF280DQ6N043 979 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PARM1Q6UWI2 310 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 C4orf50Q6ZRC1 276 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 Q6ZSV7 163 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 RBFAQ8N0V3 343 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM163Q8TC26 289 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 NLRP4Q96MN2 994 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CD180Q99467 661 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ZPBPQ9BS86 351 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 IFT27Q9BW83 186 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 SPRY4Q9C004 299 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PEMTQ9UBM1 199 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 SBNO1A3KN83 1393 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGEF10O15013 1369 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ADCY9O60503 1353 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 KIAA0232Q92628 1395 aa3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ABCA3Q99758 1704 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 A0A1W2PQF6 199 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 A6NCN8 305 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 BECN2A8MW95 431 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 STRNO43815 780 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 BAIAP3O94812 1187 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 MYZAPP0CAP1 466 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 YWHAQP27348 245 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ARRB2P32121 409 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CDH15P55291 814 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 UFM1P61960 85 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CYP4A11Q02928 519 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 GAD2Q05329 585 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 FAM27E3Q08E93 113 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CAMK1Q14012 370 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 HNF4GQ14541 408 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 GPR68Q15743 365 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 MANEAQ5SRI9 462 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PDXDC1Q6P996 788 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 DLK2Q6UY11 383 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 FAM160B2Q86V87 743 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 CEP76Q8TAP6 659 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 RFFLQ8WZ73 363 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 SLC25A28Q96A46 364 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PERPQ96FX8 193 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 TASP1Q9H6P5 420 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 BRF2Q9HAW0 419 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.19□□□□□ -1.9
TRBV1-201ENST00000476502 PREBQ9HCU5 417 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms