RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-204ENST00000466539 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 KCTD6Q8NC69 237 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MAML1Q92585 1016 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 HSPH1Q92598 858 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 NINJ1Q92982 152 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 VOPP1Q96AW1 172 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TIFAQ96CG3 184 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 HDAC11Q96DB2 347 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.49e-8■□□□□ 9.6
PSME4-204ENST00000466539 KRT12Q99456 494 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ERP44Q9BS26 406 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 S1PR5Q9H228 398 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 AMACRQ9UHK6 382 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 BPTFQ12830 3046 aa6.3□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 CFAP69A5D8W1 941 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 C5orf60A6NFR6 353 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 E9PAM4 449 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ACOT7O00154 380 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 APOL1O14791 398 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 NCAM2O15394 837 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TTI1O43156 1089 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MFSD11O43934 449 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 OPA1O60313 960 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ACSL4O60488 711 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GCATO75600 419 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 RHOP08100 348 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SPATA31D3P0C874 917 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 NAT1P18440 290 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 PI3P19957 117 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GABRR2P28476 465 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 CETN2P41208 172 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MAGEA3P43357 314 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 KCNJ1P48048 391 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 IFNAR2P48551 515 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 DNA2P51530 1060 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 NDST2P52849 883 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GYS2P54840 703 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 VSNL1P62760 191 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GBE1Q04446 702 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 WASHC5Q12768 1159 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 EFEMP1Q12805 493 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 FZD5Q13467 585 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TRADDQ15628 312 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ELF2Q15723 593 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GPR19Q15760 415 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ZNF77Q15935 545 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 CCDC181Q5TID7 509 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 FAM129CQ86XR2 697 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MREGQ8N565 214 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TEX26Q8N6G2 289 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 IGSF8Q969P0 613 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TADA1Q96BN2 335 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ALG14Q96F25 216 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.29□□□□□ -1.4
PSME4-204ENST00000466539 CALN1Q9BXU9 219 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms