RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TBATAQ96M53 351 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 WWP1Q9H0M0 922 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 PNPOQ9NVS9 261 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1G2O95670 118 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN12O95859 305 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 STC1P52823 247 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ERVFC1P60507 584 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 GALNT3Q14435 633 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 LIPMQ5VYY2 423 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TXNDC8Q6A555 127 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 RTL10Q7L3V2 364 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM199Q8N511 208 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 CNDP1Q96KN2 507 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM14Q96QK8 99 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 CDH19Q9H159 772 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.66□□□□□ -1.5
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