RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 MGAMO43451 1857 aa9.31□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 C5orf60A6NFR6 353 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF11O60813 436 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 KRT37O76014 449 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 KRT38O76015 456 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GSRP00390 522 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PRKCGP05129 697 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 THEGLP0DJG4 465 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CCINQ13939 588 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 AMZ1Q400G9 498 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SYT13Q7L8C5 426 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 HORMAD1Q86X24 394 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 MS4A14Q96JA4 679 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 FMO2Q99518 471 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GGT7Q9UJ14 662 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 K7ERQ8 282 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PIGNO95427 931 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ITGB6P18564 788 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ALDH4A1P30038 563 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GCKP35557 465 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 RANBP1P43487 201 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SUOXP51687 545 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ELOCQ15369 112 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF398Q8TD17 642 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SH3GL3Q99963 347 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 KLHL3Q9UH77 587 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CD84Q9UIB8 345 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SRCP12931 536 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SLC6A4P31645 630 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 NPY2RP49146 381 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 FNTAP49354 379 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 DET1Q7L5Y6 550 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 DCLK2Q8N568 766 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ACOX2Q99424 681 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.3□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 UTRNP46939 3433 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CITO14578 2027 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 B4DGG1 531 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 COQ9O75208 318 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ALPIP09923 528 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 JUNDP17535 347 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CD38P28907 300 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ALDH3A1P30838 453 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GKP32189 559 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CNTN1Q12860 1018 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CRYMQ14894 314 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CCNJLQ8IV13 435 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CABS1Q96KC9 395 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 MAGEB16A2A368 324 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 PRR33A8MZF0 331 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 HHLA1C9JL84 531 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CD48P09326 243 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 VIPR1P32241 457 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GRK3P35626 688 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 GNPDA1P46926 289 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-215ENST00000462256 CCT5P48643 541 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms