RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417985.1

ACTBP1-201, Transcript of actin, beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP1, Length 1,113 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP1-201ENST00000417985 GPD1P21695 349 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 OR1D5P58170 312 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 TLE1Q04724 770 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 PHF19Q5T6S3 580 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 ERAP2Q6P179 960 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 C3orf20Q8ND61 904 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 NCAPGQ9BPX3 1015 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTBP1-201ENST00000417985 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 PRSS38A1L453 326 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CREB3O43889 395 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CCNB1P14635 433 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CD1CP29017 333 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 SOX5P35711 763 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 STAT1P42224 750 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 NDST2P52849 883 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 OGDHQ02218 1023 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ARHGEF7Q14155 803 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 PNCKQ6P2M8 343 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CLEC18BQ6UXF7 455 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 DPPA4Q7L190 304 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 MON1BQ7L1V2 547 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 SRLQ86TD4 932 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 PIM3Q86V86 326 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CLEC18CQ8NCF0 446 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 RCBTB1Q8NDN9 531 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 SPOCK2Q92563 424 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 COQ10AQ96MF6 247 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ADNPQ9H2P0 1102 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 RELNP78509 3460 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 STMND1H3BQB6 276 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ECEL1O95672 775 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CEACAM5P06731 702 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 LIFP15018 202 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 KELP23276 732 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CSF2RBP32927 897 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 UGT1A3P35503 534 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 LIMK2P53671 638 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 AIF1P55008 147 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 SQSTM1Q13501 440 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 AMZ1Q400G9 498 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 MAP9Q49MG5 647 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 NAGSQ8N159 534 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 PATE1Q8WXA2 126 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 TAAR9Q96RI9 348 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 TEX101Q9BY14 249 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 SPRY4Q9C004 299 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 CDH19Q9H159 772 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 EPN3Q9H201 632 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 WDR26Q9H7D7 661 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 COL12A1Q99715 3063 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 A8MX80 341 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 PPM1DO15297 605 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 ELFN1P0C7U0 828 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 THRAP10827 490 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTBP1-201ENST00000417985 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms