RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409289.6

RBMS1-204, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-204ENST00000409289 PPFIA2O75334 1257 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 AVILO75366 819 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SUN1O94901 812 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EGFP01133 1207 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 HLA-EP13747 358 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 GLULP15104 373 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 DRD1P21728 446 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 GKP32189 559 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 AP1S1P61966 158 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CDK18Q07002 472 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 BCL2L1Q07817 233 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MTM1Q13496 603 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 E2F5Q15329 346 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 HIF1AQ16665 826 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 BBS9Q3SYG4 887 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CENPUQ71F23 418 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PDIK1LQ8N165 341 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PAF1Q8N7H5 531 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FRS2Q8WU20 508 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FAM3CQ92520 227 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PTPRN2Q92932 1015 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TADA1Q96BN2 335 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SERPINB12Q96P63 405 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ACOX2Q99424 681 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SUN2Q9UH99 717 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CA14Q9ULX7 337 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CHKBQ9Y259 395 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 AP3B1O00203 1094 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 DYNC1I1O14576 645 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 BANF1O75531 89 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 PIGNO95427 931 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MLNP12872 115 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 12
RBMS1-204ENST00000409289 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TPH1P17752 444 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CD72P21854 359 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CA4P22748 312 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MGAT1P26572 445 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ADRA1AP35348 466 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 IL12RB1P42701 662 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 WASP42768 502 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MAPK8P45983 427 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 NPY2RP49146 381 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CDH17Q12864 832 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 GALNT3Q14435 633 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 GRM3Q14832 879 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SLMAPQ14BN4 828 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SLC14A2Q15849 920 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 C2orf27AQ580R0 203 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 DENND2CQ68D51 928 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 SDE2Q6IQ49 451 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EMBQ6PCB8 327 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 RANBP10Q6VN20 620 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ZNF534Q76KX8 674 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 KDM1BQ8NB78 822 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CHST14Q8NCH0 376 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 RMDN1Q96DB5 314 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 MSANTD3Q96H12 275 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 TMEM245Q9H330 911 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.7□□□□□ -1.02
RBMS1-204ENST00000409289 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms