RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 PDIK1LQ8N165 341 aa28.27■■■□□ 2.12
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GIPC1-202ENST00000393028 LYSMD1Q96S90 227 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-202ENST00000393028 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-202ENST00000393028 MAGEE1Q9HCI5 957 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-202ENST00000393028 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-202ENST00000393028 BUD23O43709 281 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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GIPC1-202ENST00000393028 ELP6Q0PNE2 266 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-202ENST00000393028 CNGA3Q16281 694 aa28.27■■■□□ 2.12
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GIPC1-202ENST00000393028 FRMD1Q8N878 549 aa28.27■■■□□ 2.12
GIPC1-202ENST00000393028 RUBCNQ92622 972 aa28.27■■■□□ 2.12
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GIPC1-202ENST00000393028 SLC7A4O43246 635 aa28.26■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 CLDN7O95471 211 aa28.26■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 CDKN3Q16667 212 aa28.26■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 FAM47DPA6NHR8 397 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 GOLGA8CPA6NN73 597 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 AP1G1O43747 822 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 IGLV3-19P01714 112 aa28.25■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 TDGF1P13385 188 aa28.25■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 ELFN1P0C7U0 828 aa28.24■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 ANKMY2Q8IV38 441 aa28.24■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 CHMP2BQ9UQN3 213 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 TCAF1Q9Y4C2 921 aa28.24■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF318Q5VUA4 2279 aa28.24■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 E7ESA3 106 aa28.23■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 COQ6Q9Y2Z9 468 aa28.23■■■□□ 2.11
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GIPC1-202ENST00000393028 LIG3P49916 1009 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 MAP7D1Q3KQU3 841 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 FAM153CQ494X1 144 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 PCID2Q5JVF3 399 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 WDR93Q6P2C0 686 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 CXorf40AQ8TE69 158 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF778Q96MU6 729 aa28.22■■■□□ 2.11
GIPC1-202ENST00000393028 RANBP9Q96S59 729 aa28.22■■■□□ 2.11
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