RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDH19Q9H159 772 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CUEDC2Q9H467 287 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 RDH14Q9HBH5 336 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 APPL1Q9UKG1 709 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 VPS4AQ9UN37 437 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBN2P35556 2912 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A096LPE4 126 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A0D9SEW6 157 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A1W2PPZ6 126 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 EFCAB7A8K855 629 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 M0QYT0 321 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 B4GAT1O43505 415 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBXO21O94952 628 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ALPIP09923 528 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 VDRP11473 427 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRF1P14222 555 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 NR2F2P24468 414 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 L1CAMP32004 1257 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 MXI1P50539 228 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 B4GALNT1Q00973 533 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDH1Q08174 1060 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CUL2Q13617 745 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 IRF4Q15306 451 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELOCQ15369 112 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 AMZ1Q400G9 498 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAP9Q49MG5 647 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CBWD6Q4V339 395 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ALFQ53S48 1182 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 RABGAP1LQ5R372 815 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRT39Q6A163 491 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM186BQ8IYM0 893 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TTC39CQ8N584 583 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 IQUBQ8NA54 791 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TEX19Q8NA77 164 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ASB12Q8WXK4 309 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ART4Q93070 314 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDXPQ96GD0 296 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TCTN2Q96GX1 697 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 HSFY1Q96LI6 401 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC114Q96M63 670 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TAAR9Q96RI9 348 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 CASS4Q9NQ75 786 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 EXOC1Q9NV70 894 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAB20Q9NX57 234 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 B4DGG1 531 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 I6L893 689 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-398P-201ENST00000384143 NEMP1O14524 444 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms