RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 DSPP15924 2871 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 GP1BAP07359 652 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 ELFN1P0C7U0 828 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 KDELR1P24390 212 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 GALNT2Q10471 571 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 MTM1Q13496 603 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 RTP5Q14D33 572 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 ALG11Q2TAA5 492 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 MARC1Q5VT66 337 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 CDCP2Q5VXM1 449 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 GUSBP11Q6P575 273 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 HID1Q8IV36 788 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 TSGA13Q96PP4 275 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 B4GALT6Q9UBX8 382 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 AK5Q9Y6K8 562 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 CPED1A4D0V7 1026 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 LMO7DNF2Z398 122 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 YY2O15391 372 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 MFSD11O43934 449 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 SOCS5O75159 536 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 ANXA6P08133 673 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 CES1P23141 567 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 NFKBIAP25963 317 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 MMP13P45452 471 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 HK3P52790 923 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 TRAF2Q12933 501 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 ODF2Q5BJF6 829 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 TEX26Q8N6G2 289 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 BOCQ9BWV1 1114 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 CPP00450 1065 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 CCNCP24863 283 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 HTR1BP28222 390 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 CDC25BP30305 580 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 BLKP51451 505 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 TCEA2Q15560 299 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 KCTD16Q68DU8 428 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 SLC35F3Q8IY50 421 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 MAPK15Q8TD08 544 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 WDR92Q96MX6 357 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 RNF157Q96PX1 679 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 NT5MQ9NPB1 228 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-201ENST00000378543 LRRD1A4D1F6 860 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 RASGRP1O95267 797 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K6O95382 1288 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 SRP54P61011 504 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 ACOX1Q15067 660 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 NR0B2Q15466 257 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 COL28A1Q2UY09 1125 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 PELI3Q8N2H9 469 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 RAPGEF5Q92565 580 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 ABCG4Q9H172 646 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 KLQ9UEF7 1012 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 MATN3O15232 486 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 PSTPIP1O43586 416 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 SPOPO43791 374 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 NDUFA10O95299 355 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 CTSEP14091 401 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 TGM2P21980 687 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 VIPR1P32241 457 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRRQ15256 657 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 CNGA3Q16281 694 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 PERM1Q5SV97 790 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 CRTC1Q6UUV9 634 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 PQLC3Q8N755 202 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 MAML1Q92585 1016 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 GLMNQ92990 594 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 PDXPQ96GD0 296 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 COQ10AQ96MF6 247 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM202A6NGA9 273 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1024LP59773 190 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-201ENST00000378543 ELOCQ15369 112 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms