RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363350.1

RNU6-179P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 179, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-179P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZPBPQ9BS86 351 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 HAUS8Q9BT25 410 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAF1Q9H063 256 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 IL25Q9H293 177 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CD93Q9NPY3 652 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 HAO1Q9UJM8 370 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC28A2O43868 658 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZIC3O60481 467 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 USO1O60763 962 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 NDUFS7O75251 213 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 SERPINI2O75830 405 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 GAGE7O76087 117 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 BAIAP3O94812 1187 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CCNDBP1O95273 360 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 FTCDO95954 541 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 GAGE12FP0CL80 117 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 GAGE12GP0CL81 117 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 GAGE12IP0CL82 117 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 FCGR1AP12314 374 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CHMP24386 653 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 TNFRSF8P28908 595 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PBX3P40426 434 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 DCAF7P61962 342 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ECT2LQ008S8 904 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 KIF5AQ12840 1032 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 GAGE1Q13065 139 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 GAGE4Q13068 117 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 OLIG2Q13516 323 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 NAE1Q13564 534 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 KEAP1Q14145 624 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 NFATC4Q14934 902 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PLCB4Q15147 1175 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 HLFQ16534 295 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PXKQ7Z7A4 578 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 UCMAQ8WVF2 138 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 SKA1Q96BD8 255 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF570Q96NI8 536 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 MUC13Q9H3R2 512 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 KIF9Q9HAQ2 790 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 SMC4Q9NTJ3 1288 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-179P-201ENST00000363350 PROB1E7EW31 1015 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 SH3BP5O60239 455 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 PPP1R3DO95685 299 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 SCGB1D1O95968 90 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPARCP09486 303 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 T-ENOLP0DO92 83 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 LAMP2P13473 410 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 CAPN3P20807 821 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 PDLIM4P50479 330 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 DSCR9P59020 149 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 SORDQ00796 357 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRT32Q14532 448 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRT24Q2M2I5 525 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms