RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PQF6 199 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DYTNA2CJ06 578 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTP4A3O75365 173 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 VNN2O95498 520 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLYCDO95822 493 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CH25HO95992 272 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL7RP16871 459 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARRB2P32121 409 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMTP48728 403 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MXI1P50539 228 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AWAT2Q6E213 333 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SARM1Q6SZW1 724 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCGF5Q86SE9 256 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSELQ8IZU8 1212 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PELI3Q8N2H9 469 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AADATQ8N5Z0 425 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR26Q8N8Z3 221 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREB3L4Q8TEY5 395 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCFD2Q8WU76 684 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP6NLQ92738 828 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC41A2Q96JW4 573 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf74Q96LT6 269 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HARBI1Q96MB7 349 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDFY2Q96P53 400 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDF4Q9BRK5 362 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNCQ9H7C4 482 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KAT14Q9H8E8 782 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR108Q9NPR9 543 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDC14AQ9UNH5 594 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTMR6Q9Y217 621 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 STON1Q9Y6Q2 735 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GVM2 712 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3KR12 359 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 VCYO14598 125 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT9BO14905 357 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSPA12AO43301 675 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZIC3O60481 467 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFS3O75489 264 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A12O75746 678 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERPINI2O75830 405 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYC1P08574 325 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPK4P31152 587 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCYT1AP49585 367 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEP78395 509 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABATP80404 500 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSC1Q08554 894 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q0VFX4 171 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYMQ14894 314 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLFQ16534 295 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFHC1Q5JVL4 640 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL35Q6PF15 583 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PQLC2Q6ZP29 291 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTSS1LQ765P7 747 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAPLN4Q86UW8 402 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FJX1Q86VR8 437 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR63Q8IWG1 891 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXL14Q8N1E6 418 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC39CQ8N584 583 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDTC1Q8N5D0 677 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM68Q96MH6 324 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMTM3Q96MX0 182 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRFN5Q96NI6 719 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDST4Q9H3R1 872 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms