RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 TYMPP19971 482 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CALB2P22676 271 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SERPINB1P30740 379 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TSPAN7P41732 249 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CASP6P55212 293 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NUP107P57740 925 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GPR85P60893 370 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DUSP4Q13115 394 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ALG11Q2TAA5 492 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF805Q5CZA5 627 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SDHAF4Q5VUM1 108 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 KIAA1841Q6NSI8 718 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 AAGABQ6PD74 315 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CYP2U1Q7Z449 544 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 UNC93AQ86WB7 457 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DENND6BQ8NEG7 585 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 EXD1Q8NHP7 514 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF461Q8TAF7 563 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 UBA3Q8TBC4 463 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC9A6Q92581 669 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 VOPP1Q96AW1 172 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CPXM1Q96SM3 734 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SMOQ99835 787 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SYT15Q9BQS2 421 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 VCXQ9H320 206 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 COG4Q9H9E3 785 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CDH22Q9UJ99 828 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 F8VP50 259 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PIK3R2O00459 728 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FCHO1O14526 889 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC7A4O43246 635 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RGS10O43665 173 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CXCL14O95715 111 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IFNA14P01570 189 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PF4P02776 101 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NTRK1P04629 796 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SERPING1P05155 500 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ALOX5P09917 674 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ODC1P11926 461 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ATF2P15336 505 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PRKACAP17612 351 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC7A1P30825 629 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PPM1AP35813 382 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LHX1P48742 406 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GPR15P49685 360 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BMXP51813 675 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ARPP19P56211 112 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 VSNL1P62760 191 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GPR17Q13304 367 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PSMD5Q16401 504 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CCDC153Q494R4 210 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BEND4Q6ZU67 534 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 Q7L0L9 218 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 POLNQ7Z5Q5 900 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD53Q8N9V6 530 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PNKPQ96T60 521 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TCF25Q9BQ70 676 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms