RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 BANPQ8N9N5 519 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 OR7D4Q8NG98 312 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TIFAQ96CG3 184 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 NHSQ6T4R5 1651 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FANCGO15287 622 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PLIN3O60664 434 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PEX11AO75192 247 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SPOCK2Q92563 424 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PSMG2Q969U7 264 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 DACH2Q96NX9 599 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.54■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 INSIG1O15503 277 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PSMD7P51665 324 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PLCL1Q15111 1095 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 UBE2E3Q969T4 207 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SLC7A4O43246 635 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CCT8P50990 548 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 VAC14Q08AM6 782 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 NPY6RQ99463 290 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CLPTM1O96005 669 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 LDLRP01130 860 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 GPR15P49685 360 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PKNOX1P55347 436 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SYT12Q8IV01 421 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FIG4Q92562 907 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 C8orf48Q96LL4 319 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TBATAQ96M53 351 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CNMDO75829 334 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 HGFP14210 728 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 GSTT1P30711 240 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 GPR1P46091 355 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 USP4Q13107 963 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PIF1Q9H611 641 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PLK2Q9NYY3 685 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 VPS51Q9UID3 782 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.53■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ABLIM1O14639 778 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 NMBRP28336 390 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 HPCAL1P37235 193 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 DOK6Q6PKX4 331 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CUZD1Q86UP6 607 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TCF12Q99081 682 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PADI4Q9UM07 663 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 BLMHQ13867 455 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SMOQ99835 787 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SQORQ9Y6N5 450 aa16.52■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SLC28A1O00337 649 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PSME3P61289 254 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 KCNJ11Q14654 390 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PPM1JQ5JR12 505 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 SERINC5Q86VE9 423 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 NXNL1Q96CM4 212 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 SEPHS2Q99611 448 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 LZTS1Q9Y250 596 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ASB3Q9Y575 518 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ENTPD5O75356 428 aa16.52■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RRM2P31350 389 aa16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms