RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CEP290O15078 2479 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SOBPA7XYQ1 873 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 K7ERQ8 282 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM13O60858 407 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC6O75061 913 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CD70P32970 193 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 GLRBP48167 497 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PLK1P53350 603 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TTC8Q8TAM2 541 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SORT1Q99523 831 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TXLNGQ9NUQ3 528 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM114B3SHH9 223 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 FZD6O60353 706 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 KITP10721 976 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PRKAA2P54646 552 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 AFTPHQ6ULP2 937 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PNPLA1Q8N8W4 532 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 OR4K2Q8NGD2 314 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 VWA7Q9Y334 891 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TARM1B6A8C7 271 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 XYLBO75191 536 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 UNC5CO95185 931 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 LPOP22079 712 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SEMA3AQ14563 771 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SLC5A9Q2M3M2 681 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TYSND1Q2T9J0 566 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 FAM45BPQ6NSW5 357 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CLNKQ7Z7G1 428 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 FAM45AQ8TCE6 357 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 LMLNQ96KR4 655 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM14Q96QK8 99 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 WWP1Q9H0M0 922 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ABCB8Q9NUT2 735 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 HACD3Q9P035 362 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 XPR1Q9UBH6 696 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5HO75947 161 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINB3P29508 390 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ARRB2P32121 409 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SLC8A1P32418 973 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 AQP5P55064 265 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 RIN3Q8TB24 985 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TM6SF2Q9BZW4 377 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 RASSF4Q9H2L5 321 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 NOTCH4Q99466 2003 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP73A6NFT4 308 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CSNK1DP48730 415 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 STC1P52823 247 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB16Q05516 673 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 NAPRTQ6XQN6 538 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 EFHBQ8N7U6 833 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 HEXDCQ8WVB3 486 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TDP1Q9NUW8 608 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ABL2P42684 1182 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 MAPK8P45983 427 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 LIPMQ5VYY2 423 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ATG14Q6ZNE5 492 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 TTC30BQ8N4P2 665 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 MYO19Q96H55 970 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 GPAMQ9HCL2 828 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 GRIA4P48058 902 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CDKN2DP55273 166 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 FAM83EQ2M2I3 478 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PITRM1Q5JRX3 1037 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ARMC12Q5T9G4 340 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA6LQ8N4H0 392 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SAR1AQ9NR31 198 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CRYL1Q9Y2S2 319 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 PGLSO95336 258 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 SLC4A1P02730 911 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 CA3P07451 260 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD8-201ENST00000313173 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms