RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R14AQ96A00 147 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 COPS8Q99627 209 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 COL1A2P08123 1366 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CILPO75339 1184 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT14O95848 222 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CPT1BQ92523 772 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF558Q96NG5 402 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 S100A14Q9HCY8 104 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 DISP2A7MBM2 1401 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN5O00501 218 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MSCO60682 206 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PIRTP0C851 137 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF6Q330K2 333 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PMF1Q6P1K2 205 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 UBAP1Q9NZ09 502 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 DMTF1Q9Y222 760 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LRCH4O75427 683 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN2BP42772 138 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CDH13P55290 713 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CREMQ03060 361 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 IZUMO1Q8IYV9 350 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 JAM2P57087 298 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SLC1A5Q15758 541 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CERCAMQ5T4B2 595 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 BIKQ13323 160 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 DET1Q7L5Y6 550 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PLD5Q8N7P1 536 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 COQ7Q99807 217 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 FZD1Q9UP38 647 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 GPR107Q5VW38 600 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 POLE3Q9NRF9 147 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MROH2AA6NES4 1674 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 KRT77Q7Z794 578 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YYE9 177 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C75A6NL08 312 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NR2F1P10589 423 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MC4RP32245 332 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2B15P54855 530 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 NPAS2Q99743 824 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TLR5O60602 858 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PAGE1O75459 146 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 GPR1P46091 355 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 INHBEP58166 350 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T12Q8NG77 320 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ETAA1Q9NY74 926 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB7O75635 380 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK9P45984 424 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CDK9P50750 372 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT3Q14435 633 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL12Q53G59 568 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 POC5Q8NA72 575 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 BSNDQ8WZ55 320 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.982e-8■□□□□ 10.2
CCSAP-201ENST00000284617 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 EVX2Q03828 476 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF21O75509 655 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MPSTP25325 297 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 CCR4P51679 360 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 THOP1P52888 689 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 TDRPQ86YL5 185 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 MUC13Q9H3R2 512 aa21.16■□□□□ 0.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms