RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RDH14Q9HBH5 336 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM202A6NGA9 273 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP12P39900 470 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN9P43378 593 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1024LP59773 190 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM3Q14832 879 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PIM3Q86V86 326 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PYROXD2Q8N2H3 581 aa27.52■■■□□ 2
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CAPNS1-217ENST00000629983 HCAR2Q8TDS4 363 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 EPS8L1Q8TE68 723 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM168Q9H0V1 697 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4F12Q9HCS2 524 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1468Q9P260 1216 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
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CAPNS1-217ENST00000629983 BIRC2Q13490 618 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CYTH1Q15438 398 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMK4Q16566 473 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 BRAT1Q6PJG6 821 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SLFN11Q7Z7L1 901 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC20A1Q8WUM9 679 aa27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 CREB3O43889 395 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CPNE6O95741 557 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL4P13236 92 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SERINC3Q13530 473 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 AGERQ15109 404 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP15Q460N3 678 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 BORAQ6PGQ7 559 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL4L1Q8NHW4 92 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC30A5Q8TAD4 765 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 NTAN1Q96AB6 310 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 RHPN2P1A8MT19 583 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 F8VZ95 297 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 UCHL3P15374 230 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP8P22894 467 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH4A1P30038 563 aa27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 IL22RA1Q8N6P7 574 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 RCBTB1Q8NDN9 531 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 ELFN1P0C7U0 828 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GALNT1Q00973 533 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MIIPQ5JXC2 388 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSWIM9Q86XI8 627 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF677Q86XU0 584 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF10CO14798 259 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX33O43247 280 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZW10O43264 779 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 KRT3P12035 628 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GPD1P21695 349 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SKIDA1Q1XH10 827 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 STK33Q9BYT3 514 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GNT4Q9C0J1 378 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GAT1O43505 415 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA4P29622 427 aa27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-217ENST00000629983 KCNAB2Q13303 367 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MLKLQ8NB16 471 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC74BQ96LY2 380 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TAAR9Q96RI9 348 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC12A9Q9BXP2 914 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYND15Q9H091 742 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-217ENST00000629983 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
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