RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB9P50453 376 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GYS2P54840 703 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 AAK1Q2M2I8 961 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PACS1Q6VY07 963 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTN4Q8IWV2 1026 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 STYXQ8WUJ0 223 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SPOCK2Q92563 424 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 CPNE1Q99829 537 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 HEPHQ9BQS7 1158 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 HACD3Q9P035 362 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8TH3BQL2 631 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SIN3BO75182 1162 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 KAT7O95251 611 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP1P13497 986 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMA3P25788 255 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIA2P42262 883 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ABL2P42684 1182 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R2AP63151 447 aa24.99■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 Q7L0L9 218 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSWIM9Q86XI8 627 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SENP1Q9P0U3 644 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 WASF2Q9Y6W5 498 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0J9YYE9 177 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT37O76014 449 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBC1P01850 177 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTFP26441 200 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GP5P40197 560 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 CBX1P83916 185 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 UCMAQ8WVF2 138 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRABDQ9H4I3 376 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 MTG2Q9H4K7 406 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GGT7Q9UJ14 662 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPM1 405 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf81A6NN90 581 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A4O43246 635 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 BUD23O43709 281 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF234Q14588 700 aa24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPR153Q6NV75 609 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 GDPD4Q6W3E5 623 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13C4Q8NGS5 318 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQ67 120 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 HMX2A2RU54 273 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 APODP05090 189 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT2B4P06133 528 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ALPIP09923 528 aa24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 SOX9P48436 509 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE1BQ01064 536 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 CNPY4Q8N129 248 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF366Q8N895 744 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC10Q969S8 669 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 MTBPQ96DY7 904 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM245Q9H330 911 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD1Q9H3U5 465 aa24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-215ENST00000628018 HCN2Q9UL51 889 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF711Q9Y462 761 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 COL4A2P08572 1712 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM49D1C9J1S8 452 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 NEPROQ6NW34 567 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT18Q6ZVK8 323 aa24.96■■□□□ 1.59
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