RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TRIM58Q8NG06 486 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ASB12Q8WXK4 309 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 VAT1Q99536 393 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 IL21RQ9HBE5 538 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TMEM131Q92545 1883 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CFAP69A5D8W1 941 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CAPN8A6NHC0 703 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 A8MX80 341 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 THEGLP0DJG4 465 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CTPS1P17812 591 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 VIPR1P32241 457 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 IGFALSP35858 605 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RABIFP47224 123 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SKOR1P84550 965 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 IL9RQ01113 521 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 WASHC5Q12768 1159 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ARHGEF7Q14155 803 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 IRF4Q15306 451 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TEX44Q53QW1 395 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 OXR1Q8N573 874 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TTC13Q8NBP0 860 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 OR13H1Q8NG92 308 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CARD9Q9H257 536 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 GLOD4Q9HC38 313 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CHKBQ9Y259 395 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.26□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FRYLO94915 3013 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KCNK3O14649 394 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 YKT6O15498 198 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KCNN4O15554 427 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ZSCAN12O43309 604 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FZD6O60353 706 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DFNA5O60443 496 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PCCBP05166 539 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 MMP2P08253 660 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PDHA1P08559 390 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ALPIP09923 528 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ZNF883P0CG24 379 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RBP3P10745 1247 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 NFKB1P19838 968 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 LHCGRP22888 699 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 RBL1P28749 1068 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SLC14A1Q13336 389 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 GALNT3Q14435 633 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 IHHQ14623 411 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 LRRC14Q15048 493 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ACOX1Q15067 660 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SLC14A2Q15849 920 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 CNGA3Q16281 694 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PCSK7Q16549 785 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 INAVAQ3KP66 663 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DENND2CQ68D51 928 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 LIPIQ6XZB0 460 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZSR6 202 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 ZNF567Q8N184 647 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.25□□□□□ -0.93
NELFE-214ENST00000625905 NUS1Q96E22 293 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms