RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TMCO6	Q96DC7	493 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SPATA17	Q96L03	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DESI2	Q9BSY9	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	OPA3	Q9H6K4	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A0U1RQF3	1178 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PR77	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608		A8MXE2	369 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SCAMP1	O15126	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CSPG5	O95196	566 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	HOXB5	P09067	269 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TFPI	P10646	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	VDR	P11473	427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PCNA	P12004	261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MMP9	P14780	707 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	GPD1	P21695	349 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MUT	P22033	750 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MCM7	P33993	719 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	LIG4	P49917	911 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SCARB2	Q14108	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DLG2	Q15700	870 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	NAB2	Q15742	525 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ASIC2	Q16515	512 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SGO1	Q5FBB7	561 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PMS2CL	Q68D20	193 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SERPINA11	Q86U17	422 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	RNF183	Q96D59	192 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	DGAT2	Q96PD7	388 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TIMP4	Q99727	224 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MRI	Q9BWK5	157 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A096LPK6	155 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM170A	A1A519	330 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	RGS11	O94810	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CLDN7	O95471	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	C22orf31	O95567	290 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM11	P17152	192 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	BMP5	P22003	454 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	EPHB2	P29323	1055 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	THPO	P40225	353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC12A2	P55011	1212 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	GRAP	Q13588	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ARHGEF6	Q15052	776 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF398	Q8TD17	642 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	IGSF8	Q969P0	613 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	SARAF	Q96BY9	339 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	RMDN1	Q96DB5	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM68	Q96MH6	324 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TLK1	Q9UKI8	766 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	CMAHP	Q9Y471	501 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	UTY	O14607	1347 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	HSPB6	O14558	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATP9B-223	ENST00000590608	TADA2A	O75478	443 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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