RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SKILP12757 684 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 IL1R2P27930 398 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 RENBPP51606 427 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1024LP59773 190 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 LBRQ14739 615 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TMCO4Q5TGY1 634 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CRTC1Q6UUV9 634 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 LIPIQ6XZB0 460 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 DPPA4Q7L190 304 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 HID1Q8IV36 788 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 WDR92Q96MX6 357 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 LGMNQ99538 433 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CCDC3Q9BQI4 270 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 ZWILCHQ9H900 591 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 KLQ9UEF7 1012 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SEPT3Q9UH03 358 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
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CTIF-206ENST00000588345 H3BRJ5 948 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PEX11BO96011 259 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PCCBP05166 539 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CTSEP14091 401 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 GM2AP17900 193 aa18.37■□□□□ 0.53
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CTIF-206ENST00000588345 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 BOLA3Q53S33 107 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 HGSNATQ68CP4 663 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 NYAP1Q6ZVC0 841 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 POLNQ7Z5Q5 900 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 GKN2Q86XP6 184 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PLA2G15Q8NCC3 412 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PCDH19Q8TAB3 1148 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 THSD1Q9NS62 852 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 DOLKQ9UPQ8 538 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SATB2Q9UPW6 733 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 OR1A2Q9Y585 309 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 KIF26BQ2KJY2 2108 aa18.37■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 A0A1W2PQ67 120 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SOCS5O75159 536 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TNFP01375 233 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 ELFN1P0C7U0 828 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CR2P20023 1033 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TRIM23P36406 574 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 ARL4AP40617 200 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SCNN1BP51168 640 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PDX1P52945 283 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 C3orf38Q5JPI3 329 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 KCTD16Q68DU8 428 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PDXPQ96GD0 296 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SLC46A1Q96NT5 459 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 A0A1W2PQJ5 194 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TK2O00142 265 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SERPINC1P01008 464 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TCF4P15884 667 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 KELP23276 732 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PBX1P40424 430 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SKOR1P84550 965 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 KYQ8NBH2 561 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 OR6C4Q8NGE1 309 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TEKT4Q8WW24 435 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 GPR34Q9UPC5 381 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TMEM202A6NGA9 273 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 TNFRSF10CO14798 259 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-206ENST00000588345 CASC3O15234 703 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
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