RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM210A6NLX4 147 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SYCE1LA8MT33 242 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLCO1B7G3V0H7 640 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AQP7O14520 342 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PCDH17O14917 1159 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OGTO15294 1046 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN3O15551 220 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D4O60343 1298 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TBX10O75333 385 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MED24O75448 989 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SUPT3HO75486 399 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MYO1DO94832 1006 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM63AO94886 807 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF12O95522 483 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MLYCDO95822 493 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CFBP00751 764 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CSTAP01040 98 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT6AP02538 564 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT6BP04259 564 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH2P05091 517 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FYNP06241 537 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HSMCR30P0CW71 290 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC192P0DO97 292 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 VCLP18206 1134 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC9A1P19634 815 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP5P24588 427 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HMOX2P30519 316 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GP5P40197 560 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RGS19P49795 217 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RGS7P49802 495 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCR9P51686 369 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NPEPPSP55786 919 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R40P59535 323 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BPIFB4P59827 614 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OCRLQ01968 901 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GCNT1Q02742 428 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LMAN2Q12907 356 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STK4Q13043 487 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 XRCC4Q13426 336 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GPM6BQ13491 265 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RPS6KA2Q15349 733 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DLGAP5Q15398 846 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TSC22D1Q15714 1073 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP44Q17R89 818 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PARP6Q2NL67 630 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MYLK3Q32MK0 819 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZACNQ401N2 412 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CDONQ4KMG0 1287 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 THEM4Q5T1C6 240 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IL23RQ5VWK5 629 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AFMIDQ63HM1 303 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD40Q6AI12 368 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NOTUMQ6P988 496 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FOXR2Q6PJQ5 311 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SARM1Q6SZW1 724 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SZRD1Q7Z422 152 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TTC7BQ86TV6 843 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TLK2Q86UE8 772 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MON1AQ86VX9 555 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP18Q8N392 663 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LIX1Q8N485 282 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IGSF22Q8N9C0 903 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FANCBQ8NB91 859 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SETD9Q8NE22 299 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MDGA1Q8NFP4 955 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FANK1Q8TC84 345 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC8CQ8TDW0 803 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATP8B4Q8TF62 1192 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AUTS2Q8WXX7 1259 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 THRSPQ92748 146 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 VPS33AQ96AX1 596 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IQCDQ96DY2 449 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PHF21BQ96EK2 531 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HMCESQ96FZ2 354 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms