RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-208ENST00000574236 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NUDCD1Q96RS6 583 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CHP1Q99653 195 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MGME1Q9BQP7 344 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 DUSP23Q9BVJ7 150 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SPASTQ9UBP0 616 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 B4GALT6Q9UBX8 382 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CLCA2Q9UQC9 943 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TOR1BO14657 336 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 OPA1O60313 960 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TSHRP16473 764 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 E2F1Q01094 437 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PPARDQ03181 441 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 IHHQ14623 411 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NFATC4Q14934 902 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CDCP2Q5VXM1 449 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 VSTM4Q8IW00 320 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 IFI44Q8TCB0 444 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 BTN2A2Q8WVV5 523 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TSPY26PQ9H489 355 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 KIF26BQ2KJY2 2108 aa23.36■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PEX5P50542 639 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HADHQ16836 314 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ENPP7Q6UWV6 458 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HID1Q8IV36 788 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SLC35F3Q8IY50 421 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SMIM14Q96QK8 99 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 BOCQ9BWV1 1114 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SCUBE2Q9NQ36 999 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 LHX6Q9UPM6 363 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ITPR1Q14643 2758 aa23.35■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CPED1A4D0V7 1026 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CFAP69A5D8W1 941 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TPP1O14773 563 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 YY2O15391 372 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TPM3P06753 285 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 H2AFZP0C0S5 128 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ELFN1P0C7U0 828 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SERPINB6P35237 376 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MMP13P45452 471 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MTM1Q13496 603 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PERM1Q5SV97 790 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CRTC1Q6UUV9 634 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 H2AFVQ71UI9 128 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PQLC3Q8N755 202 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PAF1Q8N7H5 531 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NXPE2Q96DL1 559 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PDXPQ96GD0 296 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TBATAQ96M53 351 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 IL12RB2Q99665 862 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 UVRAGQ9P2Y5 699 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NBEAQ8NFP9 2946 aa23.34■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 A0A0U1RQS6 177 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 LMO7DNF2Z398 122 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CBFA2T2O43439 604 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CPP00450 1065 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 GP1BAP07359 652 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TGM2P21980 687 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 LHCGRP22888 699 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HK3P52790 923 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 GALNT2Q10471 571 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TRIM14Q14142 442 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 RTP5Q14D33 572 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CNGA3Q16281 694 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 COL28A1Q2UY09 1125 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MARC1Q5VT66 337 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TEX26Q8N6G2 289 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 OR1E3Q8WZA6 343 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SPOCK2Q92563 424 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 COQ10AQ96MF6 247 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NRSN2Q9GZP1 204 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 USP29Q9HBJ7 922 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NT5MQ9NPB1 228 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ABHD10Q9NUJ1 306 aa23.33■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.32■■□□□ 1.32
PHF23-208ENST00000574236 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PHF23-208ENST00000574236 TMEM202A6NGA9 273 aa23.32■■□□□ 1.32
PHF23-208ENST00000574236 MFAP3LO75121 409 aa23.32■■□□□ 1.32
PHF23-208ENST00000574236 SOCS5O75159 536 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms