RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569151.1

BBS4-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 272 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-216	ENST00000569151	MATN4	O95460	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	NPPA	P01160	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PSAP	P07602	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CYP2C8	P10632	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	IMPDH1	P20839	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	IL4R	P24394	825 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	NFKBIA	P25963	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SERPINB1	P30740	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	IDUA	P35475	653 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PTPN9	P43378	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ASPA	P45381	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CRK	P46108	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CDH15	P55291	814 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PKNOX1	P55347	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	STX1B	P61266	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TGFB2	P61812	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PHC1	P78364	1004 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MVK	Q03426	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CHRNE	Q04844	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TNK2	Q07912	1038 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SPP2	Q13103	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PEX6	Q13608	980 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DLG2	Q15700	870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	UGCG	Q16739	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	RFX4	Q33E94	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GJD3	Q8N144	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	URGCP	Q8TCY9	931 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MUL1	Q969V5	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	CIB1	Q99828	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS4-216	ENST00000569151	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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