RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 CXCR5P32302 372 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 IGFALSP35858 605 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 LIG3P49916 1009 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 IL9RQ01113 521 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ELP6Q0PNE2 266 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 XRCC4Q13426 336 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GALNT3Q14435 633 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CNGA3Q16281 694 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PCSK7Q16549 785 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KIF19Q2TAC6 998 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 STPG1Q5TH74 334 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 DENND2CQ68D51 928 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ERAP2Q6P179 960 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 LIPIQ6XZB0 460 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 DPPA4Q7L190 304 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SLC35F6Q8N357 371 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 OR13H1Q8NG92 308 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 NETO1Q8TDF5 533 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RMDN1Q96DB5 314 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 BMFQ96LC9 184 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TEKT5Q96M29 485 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GORASP1Q9BQQ3 440 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CARD9Q9H257 536 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GLOD4Q9HC38 313 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 DMTF1Q9Y222 760 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.025e-8■□□□□ 9.8
CS-211ENST00000548041 CEP250Q9BV73 2442 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KNL1Q8NG31 2342 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PTPRBP23467 1997 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 A0A0J9YYE9 177 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 VILLO15195 856 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KCNN4O15554 427 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ZSCAN12O43309 604 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TRBC1P01850 177 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SYPP08247 313 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ELFN1P0C7U0 828 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 THEGLP0DJG4 465 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 AKT2P31751 481 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 VIPR1P32241 457 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 NUDT1P36639 197 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CTSKP43235 329 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GDF10P55107 478 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 C21orf59P57076 290 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 STAT4Q14765 748 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 IRF4Q15306 451 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TEAD4Q15561 434 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 HLA-BQ31612 363 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 PELI3Q8N2H9 469 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SPOCK2Q92563 424 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TADA1Q96BN2 335 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TRIB3Q96RU7 358 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 GAREM1Q9H706 876 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-211ENST00000548041 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-211ENST00000548041 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PQ67 120 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-211ENST00000548041 CAPN8A6NHC0 703 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-211ENST00000548041 A6NNZ2 444 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms